А кто сказал подбивать под счета, тем более почему под счета а не под сч/фактуры и тов.-трансп.накладные например?
1. Если в условии договора написано "твердая договорная цена" или ничего по этому поводу не написано, то цена является твердой (посмотрите ГК "договоры строительного подряда" номер статьи недосуг сейчас искать), то принимайте как по смете.
2. Если в договоре написано, что какие-то конкретные материалы по подтверждающим документам - запрашивайте на них документы (счета, с/ф, ттн, п/п).
3. Если в договоре прописана компенсация стоимости материалов, то делайте отдельно форму компенсации, только тогда подрядчик должен дать данные по всем материалам, не только по тем, которые он купил выше сметы, но и по тем, которые ниже. Хотя, при современном уровне развития печатного дела на Западе, подделать товарно-транспортную накладную...
В общем, лучше принимайте по смете, если в ней уверены конечно.